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猪塞内加谷(SVA)病毒蛋白
    发布时间: 2023-05-27 08:52    
猪塞内加谷(SVA)病毒蛋白


猪塞内加谷(SVA)病毒蛋白;猪塞内加谷病毒VP1蛋白;猪塞内加谷病毒VP2蛋白;猪塞内加谷抗原;猪SVA抗原

塞内加谷病毒(Senecavirus A,SVA)是一种新发现的能引起猪水泡性疾病的一种小 RNA 病毒,属于小核糖核酸病毒科,

塞内加谷病毒属。其临床症状与口蹄疫、猪水泡病、水疱性口炎等病毒性疾病相似,所以临床诊断难度大。

SVA 最早是在细胞培养物中偶然发现,2014 年在巴西爆发,导致大量仔猪死亡。2015 年中国也首次分离到 SVA 中国毒株,

目前国内对 SVA 的认识尚浅,为预防大规模爆发对养殖业的影响,有必要加强感染的临床诊断及疫苗研制。

SVA VP1 蛋白是诱导中和抗体的主要成分,是抗原变异的关键结构蛋白,其核苷酸易发生变异,具有重要的抗原位点。

病毒基本信息

病毒分类:属于小 RNA 病毒科塞内加谷病毒属。

病毒形态:病毒粒子呈二十面体对称结构,无包膜,直径约为 28 - 30nm。

基因组结构:为单股正链 RNA,全长约 7.4 - 7.5kb,包含一个大的开放阅读框(ORF),编码多聚蛋白,该多聚蛋白可进一步切割成多种结构蛋白和非结构蛋白。

检测技术参数

核酸检测:

RT - PCR:是常用的检测方法,其引物设计通常针对病毒的保守区域,如 VP1 基因等。反应条件一般包括逆转录步骤,如 42℃ 30 - 60 分钟,然后进行 PCR 扩增,94℃预变性 3 - 5 分钟,接着 94℃变性 30 - 60 秒、55 - 60℃退火 30 - 60 秒、72℃延伸 30 - 60 秒,共进行 30 - 40 个循环,最后 72℃延伸 5 - 10 分钟。该方法的灵敏度较高,可检测到低至 10 - 100 拷贝 /μL 的病毒核酸。

荧光定量 RT - PCR:能更准确地定量检测病毒核酸。其反应体系和步骤与普通 RT - PCR 类似,但加入了荧光探针或荧光染料。通过标准曲线的建立,可以精确测定样品中的病毒载量,检测下限可达 1 - 10 拷贝 /μL。

血清学检测:

ELISA:可用于检测猪血清中的 SVA 抗体。包被抗原通常为病毒的结构蛋白,如 VP1 蛋白。酶标二抗一般为辣根过氧化物酶(HRP)标记的羊抗猪 IgG。反应条件为 37℃孵育 1 - 2 小时,然后用底物显色,在 450nm 波长下读取吸光度值。该方法的特异性和敏感性较高,与其他猪病毒抗体的交叉反应率低至 5% 以下。

中和试验:是检测病毒抗体中和活性的经典方法。将不同稀释度的血清与一定量的病毒混合,孵育后接种到细胞培养物中,观察细胞病变效应(CPE)。能使 50% 细胞免受病毒感染的血清稀释度即为中和抗体效价。该方法的准确性高,但操作较为繁琐,耗时较长。

疫苗相关参数

疫苗类型:目前有灭活疫苗、亚单位疫苗和核酸疫苗等研究。

灭活疫苗:通常采用甲醛等试剂对病毒进行灭活处理。灭活后的病毒失去感染性,但保留了免疫原性。疫苗中病毒抗原含量一般为 10 - 100μg/mL。

亚单位疫苗:主要以病毒的结构蛋白如 VP1 蛋白为抗原,通过基因工程技术在体外表达并纯化。抗原纯度可达 95% 以上,疫苗中抗原含量一般为 5 - 20μg/mL。

核酸疫苗:将编码病毒抗原的基因片段克隆到真核表达载体中,制成核酸疫苗。疫苗中 DNA 含量一般为 100 - 500μg/mL。

免疫效果:

免疫保护率:优质的疫苗在免疫后,能使猪群对 SVA 的攻击产生 80% - 90% 以上的保护率。

抗体产生时间:灭活疫苗免疫后,一般 7 - 10 天开始产生抗体,14 - 21 天抗体水平达到较高值;亚单位疫苗和核酸疫苗免疫后,抗体产生时间可能稍晚,一般在 10 - 14 天开始产生,21 - 28 天达到较高水平。

抗体持续时间:灭活疫苗诱导的抗体可持续 6 - 8 个月,亚单位疫苗和核酸疫苗诱导的抗体可持续 4 - 6 个月,之后需要进行加强免疫。

细胞培养参数

细胞系选择:常用的细胞系有 PK - 15(猪肾细胞系)、Vero(非洲绿猴肾细胞系)等。

培养条件:细胞培养一般使用含 10% 胎牛血清的 DMEM(杜氏改良 Eagle 培养基)或 MEM( Eagle 基本培养基),在 37℃、5% CO₂的培养箱中培养。

病毒接种与培养:将病毒接种到对数生长期的细胞中,接种量一般为 0.1 - 1 MOI(感染复数)。接种后,在 37℃继续培养,观察细胞病变效应,一般在 24 - 72 小时内可出现明显的 CPE,如细胞变圆、脱落等。收集病变细胞及其培养上清,可用于病毒的进一步研究或疫苗生产等。


塞内加谷病毒(Seneca Valley Virus,SVV)主要有以下几种蛋白,其分子结构与分子量等相关参数如下:

VP1 蛋白

分子量:约 30kDa。

分子结构

一级结构:由多个氨基酸按照特定顺序排列组成,是病毒的主要抗原蛋白,其氨基酸序列中的一些区域对于病毒与宿主细胞的相互作用、抗原性等具有重要意义。

二级结构:包含 α- 螺旋、β- 折叠、β- 转角和无规卷曲等结构元件,这些结构通过氨基酸之间的氢键等相互作用维持稳定,对 VP1 蛋白的空间构象和功能有重要作用。

三级结构:VP1 蛋白在二级结构基础上进一步折叠、盘曲形成特定的三维空间结构,通过氨基酸残基之间的疏水作用、离子键、范德华力等相互作用维持,使 VP1 蛋白能够在病毒粒子表面形成特定的抗原表位,可被宿主免疫系统识别,诱导免疫反应。

VP2 蛋白

分子量:约 28kDa。

分子结构

一级结构:由特定序列的氨基酸组成,在病毒粒子的组装和结构稳定中发挥作用。

二级结构:具有多种结构元件,与 VP1 等其他蛋白的二级结构相互作用,共同维持病毒粒子的整体结构。

三级结构:折叠成特定的空间形状,与 VP1 和 VP3 蛋白相互作用,参与形成病毒的二十面体衣壳结构,其表面的一些区域可能与病毒的细胞吸附等过程有关。

VP3 蛋白

分子量:约 22kDa。

分子结构

一级结构:由特定的氨基酸序列构成,是组成病毒衣壳的重要成分。

二级结构:存在 α- 螺旋和 β- 折叠等结构,这些结构有助于 VP3 蛋白与 VP1、VP2 蛋白相互作用。

三级结构:VP3 蛋白形成的三维结构使其能够在病毒衣壳内部与其他蛋白紧密结合,对维持病毒衣壳的稳定性和完整性至关重要,并且可能在病毒感染细胞后的脱壳过程中发挥一定作用。

VP4 蛋白

分子量:相对较小,约 8kDa。

分子结构

一级结构:由较少的氨基酸组成,但在病毒的生命周期中具有特定功能。

二级结构:可能具有简单的 α- 螺旋或 β- 折叠结构,与病毒的核酸结合或在病毒粒子的组装过程中起辅助作用。

三级结构:折叠成能够与病毒核酸及其他结构蛋白相互作用的结构,在病毒粒子内部与病毒 RNA 结合,对病毒基因组起到一定的保护作用。

3D 蛋白

分子量:约 50kDa。

分子结构

一级结构:由较多氨基酸组成,是病毒的 RNA 依赖的 RNA 聚合酶,其氨基酸序列中的特定区域负责与病毒 RNA 模板结合、核苷酸的结合与催化等功能。

二级结构:包含多个 α- 螺旋和 β- 折叠结构,这些结构形成了 3D 蛋白的活性中心和底物结合位点。

三级结构:具有复杂的三维结构,形成了能够特异性识别病毒 RNA 模板、结合核苷酸并催化 RNA 合成的活性区域,在病毒的复制过程中起着核心作用。

表达载体: 杆状病毒载体 

蛋白纯度: 大于95%(SDS-PAGE电泳)

品牌:PhyCell/费雪

规格:0.5mg,1mg

该抗原可应用于ELISA、胶体金、免疫亲和柱层析等免疫检测。

蛋白浓度:>1mg/ml,具体视批次而定

缓冲液:0.01M PBS PH7.4无防腐剂

储存条件:-20℃以下

稳 定 性: 冻融一次复检合格,有效期三年

本产品仅供研究使用,不适用于人类、治疗或诊断应用。